台灣有兩個紅毛港，一在高雄小港二在新竹縣新豐鄉新豐村中央略偏西處。
日治時期的紅毛港，沿襲清末台南府舊制隸屬台南廳鳳山縣鳳山下里。1920年台灣重劃行政區域，將原有之海汕庄南部與紅毛港庄北部靠海地區，合併為現今的紅毛港，並於紅毛港設有「紅毛港派出所」管理。1933年紅毛港公學校成立，民國40年改名海汕國民學校（海汕國民小學）；紅毛港派出所也更名海汕派出所，紅毛港主要道路海汕路，印證了前述紅毛港與海汕的地區關聯性。民國34年國民政府來台以後，紅毛港五個保分別改名為海澄、海昌、海豐、海原、海城等五村，民國56年因高雄第二港口開闢，因此面積稍減。
在1662 年2 月1 日，荷蘭人被鄭成功驅逐以後，欲思聯絡清軍反攻台灣。1663 年，荷蘭駐巴達維亞(Batavia)總督(Joan Maetzuiker)訓令特遣對司令B.Bort，以「如無平底船，改由打狗後方為之」為策略。鑒於明鄭部隊已嚴陣以待，且在打狗山置有炮城，而荷軍多數水土不服，每日皆有病亡者，加上東北季風又將結束，荷軍恐有不利，不敢戀戰，乃於2 月16 日撤離打狗南岸之據點，除四艘載運明鄭軍俘虜往福建以外，大多返回荷屬巴達維亞（葉振輝，1995:22）。荷蘭特遣艦隊停泊駐紮之地以及登陸之港口地區，為打狗港(今高雄港)南岸，即為日後所稱的紅毛港。
荷蘭人曾在此地區停泊或活動，因此紅毛港地名之由來是與荷蘭人有著密切關係。
